在新农药创制领域，清原自主研发的环吡氟草酮、双唑草酮、苯唑氟草酮、三唑磺草酮、氟草啶、氟砜草胺、氟氯氨草酯已先后获得登记上市，噁唑氟虫胺、溴噁草松等也已进入上市通道。到2030年，清原预计上市超过20个全新专利化合物，为全球作物科学发展注入澎湃动力。

在生物技术性状研发领域，清原自主开发出耐自有专利除草剂氟草啶与氟氯氨草酯的抗性基因，配套挖掘出多种抗虫、抗病新基因与新技术，并成功应用于转基因作物中。在基因编辑方面，公司拥有“CSE（循环打靶碱基编辑）”和“KSE（基因敲高）”等专利技术，能够精准“定制”抗逆、增产等目标性状。截至2025年，清原已获得3个农业转基因生物安全证书。预计至2030年，公司将累计获得20个以上安全证书。

此外，清原还在全国主要种植区建立了多个转基因测试评价基地，逐步推动耐除草剂、抗虫、抗病等性状在玉米、大豆、棉花、油菜和甜菜等作物中实现全球商业化应用，为提升农业生产力提供持续科技支撑。

截至2026年2月，清原已在全球申请发明专利2785件，已授权655件，PCT国际专利266件，其中海外专利占比63%。